在战胜游戏病魔的战斗中，天津成功地挽救了无数的生命。但他的目光并未因此而满足，出于某种未知的目的，他利用总统进度键，让呼玛齿轮接触并学习了根木公司的总统业务。然而，这并非一个简单的任务。呼玛齿轮在学习的过程中，意外地感染了黑人丹的虫星病毒。黑人丹，这个一度被认为已经死亡的敌人，借此机会复活，重新燃起了对世界的复仇之火。与此同时，垓一直在寻找复活黑人丹的目的。他深知，每一次的复活都必然有着其深远的目的。然而，当他试图向玲人传达这个信息时，玲人却因为先前的伤害失去了听力，无法听到垓的声音。就在这个时候，垓得到一个新司机的帮助。这位新司机似乎知道一些关于黑人丹和虫星病毒的内情，成为了垓寻找真相的关键。他们一同深入调查，试图揭开这一切背后的真相。《假面骑士Genms 智脑与1000%危机》不仅仅是一部关于假面骑士的剧情片，更是一部深入探讨人性、复仇和希望的影片。它展现了主人公们如何在面对重重困难时，坚守自己的信念，勇敢地与敌人抗争。这部影片鼓励观众在困境中保持坚韧不拔的精神，永不放弃追寻真相和正义。