在未来的某个时代，人类社会中存在着一个鲜为人知的群体——死刑囚。他们被社会所抛弃，生活在绝望的边缘。其中一位名叫佐竹博文的死刑囚，因杀害了自己的婚约者而被判处极刑。然而，佐竹却有着不为人知的过去，他曾是一个在绝境中多次逃生的“不死人”。在佐竹的生命即将走到尽头之际，一个名为“人类瑕疵大学”的研究机构对他产生了浓厚的兴趣。这所大学致力于研究人类的各种瑕疵，以及如何利用这些瑕疵为人类带来新的可能性。他们认为佐竹的身体有着不同寻常的特质，希望通过研究他来揭示隐藏在人类基因中的秘密。为了实现自己的目的，佐竹被迫与这所大学的研究员合作。在研究过程中，他逐渐发现自己的身体开始发生异变，不仅拥有了超乎常人的力量，还展现出了一些神秘的能力。与此同时，佐竹也意识到这所大学背后的阴谋远比他想象的要复杂得多。在探索真相的过程中，佐竹结识了一些志同道合的伙伴，他们同样被这所大学所囚禁并研究。为了摆脱囚笼，他们开始了一场惊心动魄的逃亡之旅。在这个过程中，佐竹逐渐明白自己的使命，他不仅要为自己正名，还要揭露这所大学的罪行，为那些被囚禁的同伴争取自由。《人类瑕疵大学》不仅仅是一部关于逃亡与追捕的故事，更是一场对人性的深度探讨。通过佐竹的视角，观众将见证一个死刑囚如何在逆境中重获新生，以及如何面对自己内心的恶魔与挣扎。这部动漫将带领观众进入一个充满悬疑与奇幻的世界，让人不禁思考何为人性、何为自由。